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equipe mixte d'accueil n°3733 bioingénierie et dynamique microbienne aux interfaces alimentaires en | fr accueil a propos contact plan du site espace privé accueil navigation actualités collaborations informations pratiques la recherche production scientifique thèses en cours thèses soutenues les sites membres pôle microbiologie pôle physico-chimie/procédés service administratif service technique stagiaires, doctorants... offres de stages actualités bioingenierie et dynamique microbienne aux interfaces alimentaires bioengineering and microbial dynamics at food interfaces (equipe mixte d’accueil n°3733, isara lyon - université lyon 1 ) (co-habilited team isara lyon and university lyon 1) le laboratoire , créé le 1er janvier 2011 sous la double tutelle de l’université lyon 1 et de l’isara lyon est issu de la fusion du lrgia (laboratoire de recherche en génie industriel alimentaire) et de l’unité emc (ecosystèmes microbiens complexes). il regroupe sur ses 2 sites de l’agrapôle à lyon-gerland (isara) et du technopole alimentec (dans les locaux du site de bourg en bresse de l’iut lyon 1) environ 25 personnes dont 12 enseignants-chercheurs. , was created on january, 1st. 2011. the team is under the supervision of both university claude bernard lyon 1 and isara lyon, and is the resultant of the grouping of lrgia (laboratoire de recherche en génie industriel alimentaire- lyon 1 university) and emc (ecosystèmes microbiens complexes -isara lyon). the laboratory has 2 locations : on agrapôle (lyon-gerland) for isara and on alimentec (iut lyon 1, bourg-en-bresse). the research activities gather 25 persons, including 12 academic researchers . photo : ©eric le roux/communication/ucbl l’enjeu des recherches conduites par l’équipe concerne la maîtrise de la qualité microbiologique des productions alimentaires avec une focalisation sur les produits frais et les surfaces à leur contact au cours de leur élaboration puis de leur conservation. is developing activities from basic research to applicative goals, thorough studying the mechanisms involved in the biopreservation of foods. biopreservation concepts are based on the exploitation of the antimicrobial activity of natural extracts, molecules or biological agents (microorganisms such as those contributing to the preservation of traditional fermented foods or bacteriophages). this allows to propose innovative approaches inspired from the observation of interactions between microorganisms and their environment. la question de la dynamique microbienne aux interfaces alimentaires est centrale dans ces travaux. ceux-ci concernent : l’étude des mécanismes de bioprotection d’aliments traditionnels : il s’agit d’identifier et caractériser des agents de biopréservation (bactéries lactiques, protéines ou peptides antibactériens (lactoferrine et ses fragments, bactériocines) et de façon plus récente des extraits végétaux (huiles essentielles notamment)) en système alimentaire réel, modèle ou de façon isolée pour une meilleure compréhension de leur mécanisme d’action le développement de stratégies innovantes d’association agents de biopréservation-biopolymères (par dispersion, encapsulation, incorporation dans des matériaux) pour favoriser leur stabilité et leur efficacité (notamment via un relargage contrôlé) finding application fields of these innovative biopreservation routes implies : • in-depth understanding of the mechanisms of biopreservation of traditional foods • design of innovative materials to improve food microbial safety (for example antimicrobial packaging). . - site de lyon (isara) : - lyon adress (isara) : isara, département production agro-alimentaire et qualité, agrapôle, 23 rue jean baldassini, f-69 364 lyon cedex 07 tel : +33 (0)4 27 85 85 85 fax : +33 (0)4 27 85 86 37 e-mail : ydemarigny@isara.fr - site de bourg en bresse (iut lyon 1) : - bourg en bresse address (iut lyon 1) : technopole alimentec, rue henri de boissieu, f-01000 bourg en bresse tel : +33 (0)4 74 45 52 52 fax : +33 (0)4 74 45 52 53 e-mail : pascal.degraeve@univ-lyon1.fr les sites le site de bourg-en-bresse de est hébergé par le technopôle alimentec . le site de lyon est hébergé par l’i sara lyon la recherche pour visualiser le poster de présentation des activités de recherche de , cliquez sur l’icône ci-dessous : la thématique de recherche de l’équipe s’inscrit dans le domaine de l’étude des interactions microbiennes aux interfaces, avec pour objectif la maîtrise des contaminations des aliments par les flores d’altération ou pathogènes au cours de leur itinéraire technologique d’élaboration puis de conservation. l’activité du laboratoire dans le domaine de la maîtrise de la qualité hygiénique des aliments et de leur environnement de production porte ainsi à la fois sur : l’étude des mécanismes de biopréservation d’aliments traditionnels avec une expertise concernant les filières fromagères. le laboratoire a ainsi participé à la mise en évidence de la présence de consortia microbiens inhibant le développement de souches de listeria monocytogenes tout au long du cycle d’utilisation de planches en bois employées comme support d’affinage pour une production fromagère traditionnelle. ce type de travaux contribue par exemple à établir les bases scientifiques nécessaires pour étayer des recommandations dans des guides de bonnes pratiques de fabrication destinés aux professionnels d’une filière de production. les objectifs sont de : prévenir les accidents technologiques, maintenir des pratiques en lien avec la typicité des produits alimentaires, garantir la qualité hygiénique et sensorielle des productions localisées le développement d’approches innovantes pour améliorer la qualité hygiénique des productions alimentaires. celles-ci ont jusqu’à présent essentiellement reposé sur la fonctionnalisation de matériaux (par exemple d’emballage (films éther-cellulosiques, matériaux rigides biodégradables à base de farine de maïs) ou textiles (coton-polyester) par des molécules antimicrobiennes non volatiles (nisine, lysozyme, phmb, argent…)). ces agents antimicrobiens peuvent être incorporés dans ces matériaux au cours de leur élaboration ou déposés sur ces matériaux après celle-ci. les modes d’incorporation et/ou les techniques de dépôt de ces agents antimicrobiens, la structuration de ces matériaux et la nature des interactions qu’ils établissent avec ces agents antimicrobiens sont autant de facteurs qui conditionnent leur stabilité comme leur activité antimicrobienne et leur mode d’action qui dépend notamment des cinétiques de transfert de ces agents antimicrobiens vers la surface des matrices alimentaires à leur contact. la compréhension fine des mécanismes par lesquels des micro-organismes contribuent à la biopréservation d’aliments dans des systèmes traditionnels permet désormais aussi d’envisager d’étendre leur emploi à la conservation d’autres produits alimentaires tels que les produits frais ce qui constituerait une innovation tout à fait originale. sur un plan scientifique, le développement de ces applications repose notamment sur la maîtrise des interactions microbiennes aux interfaces (en particulier à la surface des aliments et des matériaux à leur contact). la conduite des travaux de l’équipe est ainsi fortement interdisciplinaire nécessitant d’associer des compétences en microbiologie, physico-chimie et biochimie des systèmes alimentaires (incluant les matériaux au contact des aliments). le laboratoire est ainsi structuré en 3 pôles de compétences qui rassemblent chacun du personnel et des équipements sur les 2 sites de lyon et de bourg en bresse. un coordonnateur de chacun de ces 3 pôles participe à l’animation de l’équipe pour favoriser l’interdisciplinarité. les activités de recherche sont conduites avec des partenaires publics (collectivités territoriales notamment), des centres techniques et/ou des entreprises, soit dans le cadre d’appels d’offre régionaux, nationaux (anr…) ou européens, soit dans le cadre de partenariats directs. prod

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